تسقط أربع سلاحف في المجاري ويصادقها هاماتو يوشي، وهو رجل ياباني أُرسل إلى نيويورك وأُجبر على العيش في المجاري. في أحد الأيام رأى توهجًا أخضر غريبًا يحول السلاحف الأربعة إلى مخلوقات تشبه الإنسان. يتحول هاماتو (الآن ماستر سبلينتر) إلى فأر عملاق من التوهج الأخضر ويعلم السلاحف مهارات النينجا أثناء تعاونهم مع مراسل الأخبار إبريل أونيل للقتال ضد عدو يوشي اللدود شريدر وكرانج، أمير الحرب الفضائي من دايمنشن. X.